Прошло 40 лет после победы повстанцев на Эндоре. Люк Скайвокер открыл академию джедаев на Явине IV. Численость джедаев растет. Хан Соло женился на Лее Органе. Они оба стали непревзойденными дипломатами. Республика процветает. Всего то навсего что надо делать? добивать остатки жалких имперцев и все! Вновь ввели систему клонов. теперь основная часть армий составляют послушные власти клоны. Казалось никаких причин для беспокойства не было. Но в ТОТ день все переменилось. Лея с Ханом возвращаясь с переговоров на "Тысячелетнес Соколе". В системе подачи топлива что то отказало, топливо гачало вытекать из труб, в результате замыкания проводов топливо начало гореть и корабль взорвался.

На очередной схватке с Империей  погибли величайшие джедаи: Кайл Катарн и Люк Скайвокер. Республика была поражена таким количеством потерь. И как раз в этот момент атаки имперцев стали более плодородными, они выигрывали битву за битвой. Только один человек мог противостоять напору Имперских войск, это глава Ордена Джедаев, совместный ученик Кайла и Люка, ученик превзошедший их самих в мастерстве в 5 раз. Это Джейден, так же известен как Молния из-за его невероятно быстрых движений. Он мог владеть как и темной силой так и светлой, причем не переходя на темную. Это единственный джедай за всю историю, который смог достичь такого мастерства. Сможет ли новый Верховный магистр справится с этим?